5月起跨境电商年销售达新台币48万元须登记缴税，业者认为，消费者将成财政部跨国追税最大输家，但财政部表示，此举是为了建立公平租税环境，也是国际趋势。
为掌握税源，健全税制，财政部参考经济合作暨发展组织建议，以及欧盟、韩国与日本等国家作法，于去年12月28日修正营业税法部分条文，明定境外电商营业人利用网络销售电子劳务予境內自然人，应于台湾办理税籍登记及报缴营业税，并于今年5月1日施行。
财政部说明，台湾营业税属消费税，税赋负担者为买受人。由于境外电商营在台无固定营业场所，销售劳务时依营业税法规定，由境內自然人自行报缴营业税，但每笔给付金额在新台币3000元以下可免纳营业税。
然而网络交易兴起后，基于网络交易讯息隐密不易掌握，以及3000元免税门槛规定，造成税收流失，并产生境內及境外电商的租税不公平现象，因此财政部参考国际作法，将课税主体由境內自然人，转换为境外电商营业人，以利国、內外营业人公平竞争并兼顾经济发展。
在课税新制上路后，据传包含App Store、Google Play在內的跨境电商平台，会把5%营业税加入定价系统，以后购买App或者其他网络服务，消费者将负担更多的费用，因此有业者表示，财政部向境外电商追税，但跨境电商业者只会把营业税转嫁给消费者，消费者恐成最大输家。
对此财政部解释，目前邻近国家已有韩国、日本、新西兰及澳洲实施跨境电商课税新制，新加坡也于日前宣布将于近期跟进实施，显然对跨境电商课税已成国际趋势；而新制实施后，境外电商将与境內电商负担相同的税负，可建置国內外业者公平竞争的租税环境，并避免政府税收的流失。
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