日据时期，台湾农民开始使用化学肥料增产粮食。光复后至民国62年，政府采先发放肥料挹注作物生长，待收成后再以农产品偿还的肥料换谷机制，助经济起飞，也培育肥料工业发展。
国家发展委员会档案管理局的资料指出，日据时期，日本施行“工业日本、农业台湾”并引进化学肥料，用于甘蔗与稻米栽种，随着肥料需求量不断增加，先后在高雄、基隆、宜兰等地设置化学肥料工厂，投入各种肥料生产，奠定台湾化学肥料的生产基础。
民国34年10月，台湾光复之际，稻谷产量不及往年一半，市场上米价飞扬。35年底，台湾省行政长官公署成立台湾肥料运销委员会，将肥料成本、行政费、运输费等并入计算，致使肥料贩售价格提高，农业生产因而陷入危机中。
39年，政府为因应播迁来台，争取美援提供化学肥料及技术援助化学肥料工厂量产；为供应军公教配粮，调节市场稻谷价格，持续透过化学肥料掌控粮食来源，规定农民以稻谷交换肥料。
由于地方合作社与农会整并，肥料换谷统一从粮食局配售到农会，而农民可至当地农会以稻谷领取肥料，若无多余稻谷，则可先取得肥料，至收成后才缴还榖物。
台湾农民获得化学肥料用于农作生产，农业产值不断增加，不仅助益经济起飞，也培育肥料工业发展。只是，在肥料换谷的过程中，农民多认为公定肥料价格过高，稻米价格偏低，因此建议政府调降肥料换谷的比率。
随着农业生产与经济结构的转变，加上工业蓬勃发展，台湾农业面临转型，肥料换谷政策在62年走入历史。从62年起，政府停止实施肥料换谷的政策，农民可在市场上直接购买化学肥料。
之后，出现稻谷生产过剩的情况，政府则以保障收购价格因应，为此详细订定收购蓬莱谷、在来谷等项验收标准，规定合作社等经收单位必须“专仓保管”收购的稻谷，以确保农民的基本收益。
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